Juniors M.D. nace del movimiento nacional Acción Católica. Sin embargo, la autonomía de la delegación de Valencia de A.C. fue creciendo, gracias a la formación y organización de sus centros. En este contexto, en la Asamblea General de 1980, un sector, con D. Jesús Quinzá al frente, resaltó la falta de eficacia de la dirección del Movimiento. En 1982, tras reunirse con los órganos estatales de A. C., se solicitó continuar trabajando dentro de su estructura pero con líneas específicas de trabajo. La respuesta de la comisión estatal llegó la Nochebuena de 1982: la sede de Valencia quedaba fuera del movimiento nacional. Esto obligó a replantear el rumbo, ya que era irrenunciable la vocación parroquial y diocesana del movimiento. Esta identidad, trabajada desde las vicarías y centros hizo posible la creación de un nuevo movimiento.
Los primeros 10 años fueron de consolidación de la nueva orientación. Para ello, se unificaron metodologías de trabajo y se crearon los objetivos del Movimiento, bajo la presidencia de Vicente Pascual. En 1986 se publica el documento “Etapas de formación de Juniors M.D.”, que proporcionaba una referencia del método de trabajo que había de seguirse con los niños y adolescentes. Este documento coincide en el tiempo con la creación de “Juniors Escola d’Animadors”. Más tarde, en 1989, todo esto evoluciona y se publica el “Manual de Rasgos de Identidad”, que planteaba la finalidad, el Proyecto Educativo, la metodología, los miembros y los rasgos de identidad propios de Juniors M.D. Este trabajo se iba completando con las Campañas Diocesanas de Animación que se comenzaron a realizar a partir de 1987.
La realidad que se observaba en los centros a finales de los años 90 hizo replantearse la formación a través de las campañas anuales, que se reconvirtieron así en Campañas Diocesanas de Formación. La crisis de participación de los jóvenes en la Iglesia y en la sociedad en estos años hace plantear a los responsables de Juniors M.D. la necesidad de revisar en profundidad el Proyecto Educativo que, a petición del Arzobispo de Valencia, Rvdo. Sr. D. Agustín García-Gasco Vicente, se amplió acogiendo desde la infancia y adolescencia hasta la juventud. Esta importante tarea se asume mediante un proceso que requiere su adaptación a la nueva realidad social de la Diócesis de Valencia. Así, en el 2002 se presenta la actualización de los Rasgos de Identidad, de la que, en 2003, nace el nuevo Proyecto Educativo Juniors.
En 2005 surgió la inquietud de celebrar el 25 Aniversario de la fundación diocesana de Juniors. Con esto, se pretendía impulsar el Movimiento. El aniversario se inauguró con la Campaña de Animación y Formación 25 Sempre Units! Durante todo un curso se llevaron a cabo iniciativas a nivel diocesano, de Vicarías y Zonas. Destaca la Trobada Diocesana de Joves y la Trobada Sempre Units!, que tuvo lugar el 11 de noviembre de 2007 en Valencia. En ella, participaron cerca de 9.000 Juniors de todas las generaciones y tuvo su momento más importante con la celebración de la Eucaristía de acción de gracias, presidida por el Sr. Arzobispo D. Agustín García-Gasco. El 25 Aniversario se clausuró en San Mauro de ese mismo año con la publicación de la Carta Sempre Units! que recoge las aspiraciones de todos los que formamos parte de Juniors.